亿万富翁艾瑞克的海上船队接连在百慕大失事，为了找寻百慕大失事的真相，他邀请两位科学家埃米尼·帕特森和布鲁斯·盖勒、一位采访百慕大的专业记者霍华德·托马斯、通灵的精神病专家斯坦·莱森组成一个探险小组，前去探寻事实的真相。而报酬竟是每人五百万美元的巨额奖金，面对如此大的诱惑，四人决定冒险一试。然而在他们抵达百慕大中心区域，发现一些端倪后，却被神秘组织劫持，后被放逐回迈阿密。 小组成员不断有人想放弃冒险，但异象接二连三地出现。为了探寻发生在自己身上的怪异现象的原因，他们再次走到一起。在寻找一位空难幸存者的家属时，无意中发现了事实的真相。原来这一切异常现象都起源于1943年美国政府在大西洋上做的一个实验。海军意图利用百慕大发现的神秘物质进行实验，改变一艘海军军舰的分子结构，让它消失不见。实验失败了，伴之以船上士兵离奇消失，文件嵌入甲板等异象。 这次实验的另一个后果就是，空间出现裂缝，凡是接触到这个区域的人，都会出现“幻象”，见到不属于这个时空的超现象。这些超现象是真实的，但对于见到的人而言，不可思议的现象接连出现，简直就好像自己大脑出了问题、神经失常了。但更糟糕的是，为了修复这个裂缝，海军部长竟决定用反冲击的方法。在四位科学家看来，这无疑将会造成更大的灾难。为了阻止事情进一步恶化，他们不惜冒生命危险，最终力挽狂澜。 四位探险者的生活更是在揭开百慕大三角的谜团中被彻底改变。离婚的记者在终结百慕大的时空裂缝后获得第二次选择机会，及时弥补了与妻子的感情危机，维持了失去后才知道珍贵的家庭。女科学家在终结百慕大时空裂缝中找到出生即被母亲遗弃的真相。绿色环保组织成员在终结百慕大时空裂缝后终于找回正常的生活，可以安然地守护在自己的妻子与两个儿子身边。因为拥有了对生活的第二次选择，他们大多能够弥补曾经的遗憾，找到美好的人生。
